Клинические случаи метастатического колоректального рака, ассоциированные с мутациями A146V, A59G гена KRAS
https://doi.org/10.47093/2218-7332.2023.14.2.49-56
Аннотация
При колоректальном раке (КРР) в дополнение к наиболее распространенным мутациям во втором экзоне KRAS встречаются более редкие мутации, недостаточно изученные в качестве прогностических маркеров.
Описание случаев. Представлены два клинических случая умеренно дифференцированной аденокарциномы (low-grade, G2), манифестировавшей осложненным течением у женщины 67 лет – кишечная непроходимость (случай 1) и у мужчины 62 лет – паратуморозный абсцесс (случай 2). Оба случая характеризовались развитием регионарных и отдаленных метастазов (печень, головной мозг) и коротким безрецидивным периодом. Обнаружены редкие спорадические мутации KRAS A146V и A59G с микросателлитной стабильностью и отсутствием мутации в сайте V600 BRAF.
Обсуждение. В представленном случае 1 выявлена мутация KRAS A146V, частота ее обнаружения в нашей практике тестирования 2103 случаев КРР составила 0,48%. Случай 2 демонстрирует крайне редкую мутацию A59G. Среди исследованных нами пациентов с КРР мы обнаружили мутации в 59 кодоне лишь у двух, что составило 0,095%. Обе редкие мутации представляют отдельные молекулярные подгруппы КРР, характеризующиеся неблагоприятным клиническим исходом и требующие разработки специальных схем лечения.
Ключевые слова
Белки семейства RAS функционируют как молекулярные переключатели на пересечении жизненно важных сигнальных путей, обеспечивающих рост, пролиферацию, дифференцировку и выживание клетки. Многие соматические мутации гена KRAS (Kirsten Rat Sarcoma Viral Oncogene Homolog, гомолог вирусного онкогена саркомы крысы Кирстена) известны как онкогенные и встречаются при разных типах рака, включая колоректальный рак (КРР), немелкоклеточный рак легкого, протоковую аденокарциному поджелудочной железы и прочие [1]. Участие в онкогенезе обусловлено активированным состоянием мутантного KRAS, что приводит к постоянной передаче сигнала по нижестоящим путям и ассоциировано с агрессивным течением заболевания и неблагоприятным прогнозом [2].
Распространенность разных типов мутаций KRAS связана с локализацией злокачественного процесса: наиболее часто у пациентов с немелкоклеточным раком легкого идентифицируют G12C (13,6%), а у пациентов с КРР – G12D (12,5%) [1]. Вносит свой вклад в распределение частот генетических вариантов и популяционная составляющая. Так, например, мутантный статус KRAS обнаруживается в 45% случаев КРР, зарегистрированных в США, и в 49% случаев в Китае; в 35% случаев аденокарцином легких в США против ~13% в Китае [1]. Согласно реестру пациентов с метастатическим КРР, проходивших лечение в ФГБУ «НМИЦ онкологии» Минздрава РФ с 2013 по 2021 год, частота мутаций во 2, 3 и 4-м экзонах гена KRAS составила 39,6% (n = 2103), бóльшая часть из них (38%) была представлена мутациями в кодонах G12 или G13 второго экзона (G12D, G12V, G12C, G13D, G12R и G12A). Спектр изменений в этом гене дополняют редкие варианты, биологическая значимость которых до конца не ясна.
Известно, что наличие активирующей мутации в гене KRAS предопределяет нечувствительность опухоли к анти-EGFR (epidermal growth factor receptor, рецептор эпидермального фактора роста) терапии и низкую эффективность стандартной полихимиотерапии (ПХТ) [3]. Разработка таргетных препаратов – специфичных, собственно, к онкогенам семейства RAS (KRAS; HRAS, Harvey rat sarcoma viral oncogene homolog, гомолог вирусного онкогена саркомы крысы Харви; NRAS, neuroblastoma RAS, нейробластома RAS) – считается перспективной, однако сталкивается с трудностями [4]. Предлагаемые ингибиторы, действующие как конкуренты гуанозинтрифосфата, оказались малоэффективными в связи с широкой доступностью последнего в клетке и высоким сродством к KRAS. Кроме того, третичная структура белка KRAS имеет почти правильную сферическую форму без очевидных сайтов связывания [5]. Тем не менее три десятилетия усилий позволили разработать для клинической практики аллель-специфичные ингибиторы, нацеленные на конкретную мутацию [6][7].
Редко встречающиеся варианты мутации KRAS также требуют дальнейших исследований, необходимых как для прогноза клинических исходов, так и для разработки персонализированных терапевтических стратегий. Представляем клиническое наблюдение двух пациентов с КРР, в опухолях которых обнаружены редкие мутации KRAS – A59G и A146V.
ОПИСАНИЕ СЛУЧАЕВ
Случай 1. Женщине 67 лет 16.06.2022 по поводу острой кишечной непроходимости, вызванной новообразованием на уровне ректосигмоидного отдела, наложена сигмостома; направлена в ФГБУ «НМИЦ онкологии» МЗ РФ.
По данным фиброколоноскопии на расстоянии 19 см от анодермальной линии обнаружена опухоль, которая суживает просвет кишки, непроходима для колоноскопа; патоморфологическое исследование биоптата выявило умеренно дифференцированную аденокарциному. Компьютерная томография (КТ) органов брюшной полости, малого таза показала стенозирующую опухоль ректосигмоидного соединения до 49 мм в диаметре, метастатическое поражение регионарных лимфоузлов, множественное поражение обеих долей печени метастазами до 18 мм в диаметре.
Клинический диагноз: рак ректосигмоидного соединения толстой кишки T3N2bM1a (HEP), IV стадия, 2 Кл. гр. Сопутствующие заболевания: Атеросклеротический кардиосклероз. Артериальная гипертензия. ECOG-1.
28.07.2022 выполнены: циторедуктивная передняя резекция прямой кишки с ликвидацией сигмостомы, биопсия метастаза печени. Послеоперационное гистологическое исследование: в стенке толстой кишки умеренно дифференцированная аденокарцинома (low-grade, G2) с изъязвлением, очаговой инвазией в субсерозную основу, периваскулярной и периневральной инвазией, лимфоидной инфильтрацией по периферии опухоли. В лимфатических узлах и в печени метастазы аденокарциномы.
Молекулярный профиль опухоли: микросателлитная стабильность, обнаружена мутация A146V (NM_004985.5: c.437C>T; p.Ala146Val) в гене KRAS и отсутствие мутации в сайте V600 BRAF (Serine/ threonine-protein kinase B-raf, cерин/треониновая протеинкиназа B-raf) (рис. 1).
08.09.2022 мультидисциплинарным консилиумом с учетом результатов молекулярно-генетического исследования, наличия мутации KRAS, рекомендовано проведение 4-х курсов ПХТ с таргетной терапией бевацизумабом по схеме: оксалиплатин 85 мг/м2 в 1-й день + 5-фторурацил (5-ФУ) 400 мг/м2 в/в струйно в 1-й день + 5-ФУ 2400 мг/м2 (по 1200 мг/м2 в сутки) 46-часовая инфузия в 1–2-й дни + бевацизумаб 5 мг/кг в 1-й день; интервал – 14 дней, КТ-контроль через 2 месяца.
Пациентка по месту жительства терапию не получала (в связи с сопутствующей патологией). При контрольном обследовании 09.02.2023 г. по данным КТ органов грудной клетки, брюшной полости и малого таза выявлено прогрессирование заболевания с увеличением размеров метастазов в печени с 18 до 65 мм, появлением тотального очагового остеолитического метастатического поражения костных структур. При удовлетворительных общем состоянии и показателях крови, отсутствии противопоказаний назначена рекомендованная ранее схема лекарственной терапии совместно с золедроновой кислотой.
Общая выживаемость на момент контрольного обследования составила 8 месяцев.
Случай 2. Пациент Р. 62 лет 25.01.2022 госпитализирован с симптомами острого живота. На основании КТ органов брюшной полости, малого таза выявлена опухоль слепой кишки до 85 мм в диаметре с наличием паратуморозного абсцесса, метастатическим поражением регионарных лимфоузлов.
Клинический диагноз: злокачественное новообразование слепой кишки T4aN2aM0, IIIC стадия, осложненное развитием паратуморозного абсцесса, 2 Кл. гр. Артериальная гипертензия, ECOG-2.
Проведена срочная лапаротомия, выполнена правосторонняя гемиколэктомия, вскрытие и дренирование абсцесса. Патоморфологическое исследование операционного материала: умеренно дифференцированная аденокарцинома (low-grade, G2) толстой кишки, в лимфатических узлах метастазы аденокарциномы.
По месту жительства начата ПХТ по схеме FOLFOX-6: оксалиплатин 85 мг/м2 в 1-й день + 5-ФУ 400 мг/м2 в/в струйно в 1-й день + 5-ФУ 2400 мг/м2 (по 1200 мг/м2 в сутки), 46-часовая инфузия в 1–2-й дни. Интервал – 14 дней. После проведения девяти курсов ПХТ пропала речь, появилась головная боль и онемение правой верхней и нижней конечности, периодически отмечалась спутанность сознания.
Направлен в ФГБУ «НМИЦ онкологии» МЗ РФ, где 29.07.2022 на основании магнитно-резонансной томографии головного мозга выявлено прогрессирование процесса: признаки метастатического поражения левой височной доли с дислокацией срединных структур вправо.
11.08.2022 метастатическая опухоль головного мозга удалена, патоморфологически подтвержден метастаз аденокарциномы толстой кишки.
В первичной опухоли толстой кишки и метастатической опухоли головного мозга идентифицирован одинаковый молекулярный профиль: микросателлитная стабильность, мутация A59G (NM_033360.4:c.176С>G; p.Ala59Gly) в гене KRAS и отсутствие мутации в сайте V600 BRAF (рис. 2).
28.10.2022 консилиумом врачей рекомендовано лечение по схеме FOLFIRI с таргетной терапией – бевацизумаб 5 мг/кг внутривенно капельно каждые 2 недели.
По данным КТ от 12.01.2023 после 4 курсов ПХТ выявлено прогрессирование заболевания с метастатическим поражением печени, брюшины, большого сальника, крестца. Рекомендовано проведение второй линии терапии по схеме: иринотекан 180 мг/м2 в/в капельно в 1 день за 2 часа, кальция фолинат 400 мг/м2 в/в капельно в 1 день за 2 часа, 5-ФУ 400 мг/м2 в/в струйно в 1 день + 5-ФУ 2400 мг/м2 в/в (по 1200 мг/м2 в сутки), 46-часовая инфузия в 1–2-й дни, цикл 14 дней + афлиберцепт 4 мг/кг в/в капельно в 1 день, цикл 14 дней, золедроновая кислота 4 мг в/в капельно 1 раз в 28 дней – длительно.
19.04.2023 после 4 курсов ПХТ на контрольном КТ-исследовании: метастазы в печени не визуализируются, метастатическое поражение крестца, брюшины и большого сальника без динамики. Общая выживаемость составила 15 месяцев, безрецидивная выживаемость – 7 месяцев. Назначена терапия по режиму de Gramont модифицированный: лейковорин 400 мг/м2 в/в в течение 2 часов с последующим болюсом 5-ФУ 400 мг/м2 в/в струйно и 46-часовой инфузией 5-ФУ 2400 мг/м2 (по 1200 мг/м2 в сутки), очередной курс на 15 день, либо капецитабин 2000–2500 мг/м2/сут внутрь в 1–14 дни, очередной курс на 22-й день. Рекомендовано добавление к данному режиму таргетной терапии: бевацизумаб 5 мг/кг в/в каждые 2 недели либо 7,5 мг/кг в/в каждые 3 недели с контролем после 4 курсов.
РИС. 1. Молекулярный профиль рака ректосигмоидного соединения толстой кишки T3N2bM1a (HEP), умеренно дифференцированная аденокарцинома (low-grade, G2) у женщины 67 лет. Секвенирование на генетическом анализаторе Applied Biosystems® 3500 (Thermo Scientific, USA). Иммуногистохимический анализ с помощью панели VENTANA MMR RxDx Panel (Roche Diagnostics GmbH, Germany)
- Сиквенсы участков KRAS, мутация A146V (стрелка).
- Сиквенсы участка BRAFдемонстрируют отсутствие мутации в V600.
- Окраска белков MMR-панели визуализирует экспрессию по интактному типу (MSS)
FIG. 1. Molecular profile of the rectosigmoid colon cancer T3N2bM1a (HEP), moderately differentiated adenocarcinoma (low-grade, G2) in a 67-year-old woman. Sequencing on an Applied Biosystems® 3500 genetic analyzer (Thermo Scientific, USA). Immunohistochemical analysis with the VENTANA MMR RxDx Panel (Roche Diagnostics GmbH, Germany)
- KRASregion sequences, A146V mutation (arrow).
- Sequences of the BRAFregion show no mutation in V600.
- MMR panel protein staining visualizes intact type expression (MSS)
РИС. 2. Молекулярный профиль рака слепой кишки T4aN2aM1, умеренно дифференцированной аденокарциномы (low-grade, G2) и метастаза в головном мозге у мужчины 62 лет. Секвенирование на генетическом анализаторе Applied Biosystems® 3500 (Thermo Scientific, USA). Иммуногистохимический анализ с помощью панели VENTANA MMR RxDx Panel (Roche Diagnostics GmbH, Germany)
- Сиквенсы участков KRAS, мутация A59G (стрелка).
- Сиквенсы участка BRAFдемонстрируют отсутствие мутации в V600.
- Окраска белков MMR-панели визуализирует экспрессию по интактному типу (MSS)
FIG. 2. Molecular profile of cecal cancer T4aN2aM1, moderately differentiated adenocarcinoma (low-grade, G2) and brain metastasis in a 62-year-old man. Sequencing on an Applied Biosystems® 3500 genetic analyzer (Thermo Scientific, USA). Immunohistochemical analysis with the VENTANA MMR RxDx Panel (Roche Diagnostics GmbH, Germany)
- KRASregion sequences, A59G mutation (arrow).
- Sequences of the BRAFregion show no mutation in V600.
- MMR panel protein staining visualizes intact type expression (MSS)
ОБСУЖДЕНИЕ
Рассмотренные клинические случаи объединяет развитие злокачественного новообразования толстой кишки в возрастном интервале 60–70 лет и осложненное течение опухолевого процесса (кишечная непроходимость, паратуморозный абсцесс), наличие регионарных и отдаленных метастазов (печень, головной мозг) на фоне умеренно дифференцированной аденокарциномы (low-grade, G2). В условиях агрессивного течения заболевания возможности применения таргетной анти-EGFR терапии и иммунотерапии были ограничены генетическими особенностями опухолей: наличием редких мутаций в гене KRAS: A146V, A59G и микросателлитной стабильностью. Подобные мутации в гене KRAS определяют биологическое и клиническое поведение опухоли, прогноз и трудности лечения вследствие резистентности к ингибиторам EGFR [8].
Молекулярные механизмы конституционной активации белка KRAS уникальны для каждой мутации и реализуются не только посредством обхода регуляции включения/выключения в цикле ГДФ-KRAS/ГТФ-KRAS (гуанозиндифосфат, гуанозинтрифосфат) [9], но и с помощью других сложных белок-белковых взаимодействий. Понимание реализации мутаций KRAS дало толчок для разработки новых специфичных для них ингибиторов. Так, например, FDA (Food and Drug Administration, Управление по санитарному надзору за качеством пищевых продуктов и медикаментов, США) одобрило ковалентный ингибитор AMG510 (соторасиб) для опухолей KRAS G12C [6], а также селективный для опухолей KRAS G12D нековалентный ингибитор MRTX1133 [7]. Для преодоления быстро развивающейся резистентности к монотерапии ингибиторами KRAS подбирают схемы комбинированной терапии [10].
Остается менее изученным молекулярный портрет опухолей с редкими мутациями KRAS. В данной работе описаны два случая с установленным диагнозом КРР, которые характеризовались микросателлитной стабильностью, спорадическими мутациями A146V и A59G в 4-м и 3-м экзонах гена KRAS, отсутствием мутации в V600 BRAF. Идентифицированные генетические варианты относят к редким аберрациям, их статус патогенности обсуждается.
Частота мутации KRAS A146V составляет около 0,12% случаев во всех спорадических злокачественных новообразованиях, при этом наибольшая распространенность зафиксирована для КРР и немелкоклеточного рака легкого. В нашей практике тестирования случаев КРР (n = 2103) доля замен в сайте A146 составила 1,8% (частота A146V – 0,48%), что ниже 8%, установленных для КРР по данным веб-платформы для анализа крупномасштабных геномных исследований (The cBioPortal for Cancer Genomics, cBioPortal.org)1.
Согласно литературным данным, опухоли с мутацией KRAS A146V представляют собой отдельную молекулярную подгруппу КРР с худшими клиническими исходами. В многоцентровом проспективном исследовании, включавшем случаи КРР с исходно нерезектабельными метастазами в печени (n = 419), у пациентов с мутацией KRAS A146 наблюдали более высокие уровни циркулирующей опухолевой дезоксирибонуклеиновой кислоты (ДНК) в плазме, ассоциированные с высокой опухолевой нагрузкой, по сравнению с пациентами с мутацией KRAS G12. Более того, носители мутации A146 показали меньшую общую выживаемость (медиана 10,7 vs 26,4 месяца; отношение рисков = 2,5; р = 0,003) [11].
Для редких мутаций, таких как A59G, определить клиническую роль сложнее вследствие трудности набора репрезентативной выборки пациентов. В нашем исследовании на 2103 случая КРР мутации в 59-м кодоне встречались чрезвычайно редко – лишь два случая, в одном A59G, другом A59Е. С помощью моделирования и кластерного анализа ряд авторов продемонстрировали, что мутация A59G, локализованная в домене переключателя KRAS, оказывает существенное влияние на структурную гибкость, внутреннюю динамику и профили свободной энергии фермента. Все эти конформационные изменения должны приводить к ослаблению связывания гуанозиндифосфата с KRAS по сравнению с диким типом [12][13]. В итоге опухоли с мутацией A59G, очевидно, будут демонстрировать активацию KRAS и, как следствие, худший клинический прогноз.
ЗАКЛЮЧЕНИЕ
Пациенты с КРР, несущие редкие мутации А146V и А59G, демонстрируют более агрессивное поведение опухоли, по отношению к которой имеются ограничения в использовании современных терапевтических средств.
Однако в будущем таким пациентам может помочь интенсивная таргетная терапия при включении в клинические исследования новых препаратов, специфичных к KRAS А146 и KRAS А59. Следует учесть, что стандартные тест-системы не способны обнаруживать данный тип мутаций, поэтому тестирование на А146 и А59 следует рекомендовать в рутинных диагностических исследованиях.
↑1. cBioPortal: Colorectal Cancer (MSK, Gastroenterology 2020). Targeted sequencing of 471 unresectable colorectal tumor/normal pairs via MSK-IMPACT.PubMed. https://www.cbioportal.org/study/summary?id=crc_apc_impact_2020 (дата обращения: 25.11.2022)
Список литературы
↑1. Hofmann M.H., Gerlach D., Misale S., et al. Expanding the reach of precision oncology by drugging all KRAS mutants. Cancer Discov. 2022 Apr 1; 12(4): 924-937. https://doi.org/10.1158/2159-8290.CD-21-1331. PMID: 35046095
↑2. Кит О.И., Геворкян Ю.А., Солдаткина Н.В. и др. Современные прогностические факторы при колоректальном раке. Колопроктология. 2021; 20(2): 42-49. https://doi.org/10.33878/20737556-2021-20-2-42-49. EDN: OUYFX
↑3. Giopanou I., Pintzas A. RAS and BRAF in the foreground for non-small cell lung cancer and colorectal cancer: Similarities and main differences for prognosis and therapies. Crit Rev Oncol Hematol. 2020 Feb; 146: 102859. Epub 2019 Dec 17. https://doi.org/10.1016/j.critrevonc.2019.102859. PMID: 31927392
↑4. Zhu C., Guan X., Zhang X., et al. Targeting KRAS mutant cancers: from druggable therapy to drug resistance. ol Cancer. 2022 Aug 4; 21(1): 159. https://doi.org/10.1186/s12943-022-01629-2. PMID: 35922812
↑5. Malumbres M., Barbacid M. RAS oncogenes: the first 30 years. Nat Rev Cancer. 2003; 3(6): 459-465. https://doi.org/10.1038/nrc1097
↑6. Hong D.S., Fakih M.G., Strickler J.H., et al. KRAS inhibition with SotoRASib in advanced solid tumors. Engl J Med. 2020 Sep 24; 383(13): 1207-1217. https://doi.org/10.1056/NEJMoa1917239. Epub 2020 Sep 20. PMID: 32955176
↑7. Wang X., Allen S., Blake J.F., et al. Identification of MRTX1133, a noncovalent, potent, and selective KRAS inhibitor. J Med Chem. 2022 Feb 24; 65(4): 3123-3133. https://doi.org/10.1021/acs.jmedchem.1c01688 Epub 2021 Dec 10. PMID: 34889605
↑8. Кит О.И., Дженкова Е.А., Мирзоян Э.А. и др. Молекулярногенетическая классификация подтипов колоректального рака: современное состояние проблемы. Южно-Российский онкологический журнал. 2021; 2(2): 50-56. https://doi.org/10.37748/2686-9039-2021-2-2-6
↑9. Araki M., Shima F., Yoshikawa Y., et al. Solution structure of the state 1 conformer of GTP-bound H-RAS Protein and distinct dynamic properties between the state 1 and state 2 conformers. J Biol Chem. 2011 Nov 11; 286(45): 39644-39653. https://doi.org/10.1074/jbc.M111.227074. Epub 2011 Sep 19. PMID: 21930707
↑10. Zhu C., Guan X., Zhang X., et al. Targeting KRAS mutant cancers: from druggable therapy to drug resistance. Mol Cancer. 2022 Aug 4; 21(1): 159. https://doi.org/10.1186/s12943-022-01629-2. PMID: 35922812
↑11. Van’t Erve I., Wesdorp N.J., Medina J.E., et al. KRAS A146 mutations are associated with distinct clinical behavior in patients with colorectal liver metastases. JCO Precis Oncol. 2021 Nov 17; 5: PO.21.00223. https://doi.org/10.1200/PO.21.00223. PMID: 3482059
↑12. Lu J., Bera A.K., Gondi S., Westover K.D. KRAS Switch Mutants D33E and A59G crystallize in the state 1 conformation. Biochemistry. 2018 Jan 23; 57(3): 324-333. https://doi.org/10.1021/acs.biochem.7b00974. Epub 2017 Dec 28. PMID: 29235861
↑13. Zhao J., Wang L., Bao H., Chen J. Cluster analysis on conformational changes of the GDP/KRAS complex induced by A59G and D33E. Chemical Physics Letters, 16 October 2021; 781: 138995. https://doi.org/10.1016/j.cplett.2021.138995